老饕食魚，尤愛野生魚鮮。不少香港人愛食三文魚，可是現時市面上的三文魚大多是養殖的，野生難求。除了時有聽說三文魚多寄生蟲，還有傳養殖三文魚會使用大量抗生素，矢言三文魚少食為妙。到㡳養殖三文魚真的能健康食用嗎？還是它含有更多的污染物和抗生素，有損健康？
挪威毒理學家 Janneche Utne Skåre 曾領導挪威食品與環境科學委員會，評估挪威食用魚類的益處和風險，並於 2006 和 2014 年發表及更新報告。一些魚類消費建議便是基於這項研究。
有關三文魚的研究顯示，養殖三文魚中的污染物其實比野生的還少。因環境毒素不會在體內分解，野生三文魚會積聚這些物質，它們許多都是脂溶性的，愈肥美的野生魚毒素含量愈高。過去在養殖三文魚中發現的污染物比野生魚類多，乃因為以往三文魚飼料是以魚蛋白和魚油為基礎，因此受到污染。如今三文魚的飼料約 7 成來自植物，因而污染程度要低於野生三文魚。
可是現時的三文魚飼料含有較少魚油，導致養殖魚類中的脂肪酸含量低於野生魚類。與野生三文魚相比，養殖三文魚儘管仍有一定含量的 omega-6 和 omega-3 脂肪酸，但比例較低。據 Skåre 指，養殖三文魚和野生三文魚在蛋白質、維他命 B12 和碘方面沒有差異。然而，養殖三文魚含有較少的硒、銅、鋅和鐵。
至於不少人所擔心的抗生素，也不用過分憂慮。2016 年挪威水產養殖業使用了 212 千克抗生素，是自 70 年代以來最低的水平。現代養殖業已為三文魚接種了針對細菌性疾病的疫苗，因此抗生素用量能大大減少。養殖三文魚的最大敵人是海蝨，則需要使用一定農藥治理。
較少為人所知的是，養殖三文魚的魚肉天然顏色其實是灰白色，為了達到所需的三文魚紅色，飼料會添加蝦青素。蝦青素除了能提供鮮活的顏色外，還是藻類和海洋動物中的強大抗氧化劑，對養殖水生動物的健康也至關重要。Skåre 說，養殖三文魚以健康及安全食用為最底線。
養殖三文魚可能對人類健康，但不幸的是，這些魚正在為自己的健康而掙扎。依附著在三文魚上的海蝨，研究人員至今仍沒法找到解決方法，還有其他幾種疾病也會影響挪威三文魚。挪威每年投放約 300 萬條三文魚幼魚，以 2016 年的統計數字，當中有 5 分之 1 死於健康問題，這個數字還沒有計算在淡水階段或運輸過程中死亡的三文魚。
海蝨是天然的寄生蟲，根據區域內的三文魚密度，它們的數量會相應增加。有些體型較細小的清潔魚可以治理海蝨問題，但不幸的是，海蝨也會困擾這些魚，令它們患病死亡。由於三文魚蝨對大多數藥物已產生了抗藥性，因此養殖者正採用新的機械滅蝨系統。
在機械滅蝨系統之下，三文魚會經過更頻繁的漂洗。挪威獸醫研究所 2016 年魚類健康報告指出，這種方法會增加鰓、鰭、眼睛和皮膚受到傷害的風險。在與該報告有關的一項調查中，93% 的養殖者報告稱，時常清洗的養殖三文魚錄得顯著的死亡率。挪威食品安全局魚類健康檢查員 Aud Skrudland 指，若廣泛使用這種三文魚清理方式，或會降低它們的抵抗力，並導致更多其他疾病爆發。
挪威的魚類疫苗接種計劃可以預防 6 種疾病，包括病毒性疾病，例如對三文魚構成最大威脅的胰腺疾病、心臟和骨骼肌炎症等。可是，一些細菌性疾病則難以根除。Skrudland 說：「近年來，我們留意到耶爾辛氏菌病（yersiniosis）爆發的數量穩步上升。」有時即使接種了疫苗，亦未必能阻止疫症爆發，例如低水溫或會引發冬季潰瘍，儘管冬季潰瘍疫苗是所有三文魚接種的標準疫苗之一。
三文魚魚苗一般於室內控制的環境培育，但三文魚幼魚則使用開放式海洋網箱飼養，三文魚因此有機會感染野生種群的病原體和寄生蟲。挪威公司 Nordic Aquafarms 正計劃在美國緬因州貝爾法斯特（Belfast）建造三文魚養殖場，預計造價 5 億美元，將成世上最大水產養殖池之一。
