上回講到，比利時人 Andreas Vesalius 的出現，顛覆了由蓋倫流傳下來的理論。
Vesalius 更找到 200 多個蓋倫與人體結構不相符的描述，是個史無前例的解剖家。最後，他發現蓋倫在古羅馬時期並沒有解剖過人類屍體，只是單純從解剖猴子及狗隻中觀察，並認為那些結構與人類相同！於是，Vesalius 推翻了所有的謬誤，並將自己的研究整合成內容豐富而詳盡的解剖圖文集「論人體結構」（De Humani Corporis Fabrica），成為了日後備受推崇的解剖書。除此之外，他亦鼓勵學生在日常生活中多留意動物結構，「在大快朵頤時，順便觀察動物的肌腱」。1539 年，Vesalius 得到帕度亞（Padua）一位法官的幫助，可以解剖被下令處決後的犯人屍體。他在學習醫學的時候，不止進行解剖，更會親自在絞架上將屍體搶奪下來。加上書本可以公開印刷發行，其研究成果得以在歐洲各地迅速流通。
因為要趕及在屍體腐爛發臭前進行解剖，所以從死亡起計，一般只有 3 到 4 天時間，冬天對他而言更是「解剖旺季」。在 23 歲畢業並得到解剖學及手術學教授一職後，Vesalius 開始自己的研究，並懷疑蓋倫的理論充滿錯誤及謬誤，包括：
- Vesalius 表明骨骼系統是身體的支架，並透過解剖去檢驗不同骨塊的質地與強度。他發現人的下顎並非如蓋倫所言的由兩塊骨頭組成，而是一整塊；胸骨亦非有 7 個小節，而是只得 3 個。最後，他解釋這些差異的出現，在於蓋倫解剖的是動物，這些發現均為動物的構造，因此與 Vesalius 解剖的人類屍體不一樣。
- 他甚至釐定大腦及神經系統為思想及情緒中心，推翻了從亞里士多德遺傳下來、以「心臟為中心」的學說；同時更追溯神經發自腦袋，能夠傳送指令及感覺到肌肉，並做出相應動作及反應。
- 蓋倫說人的肝臟上有 5 個肝葉（liver lobes），Vesalius 卻只看到兩個。
雖然 Vesalius 對解剖學有如此深的研究，但他亦非常小心翼翼，沒有闖入會讓基督教會不高興的領域。不過，雖然他推翻了亞里士多德對於心臟的一說，卻沒有企圖糾正心臟與靈魂的關係及結論。這樣的留白引起了兩極批評，有些人認為 Vesalius 研究的人與蓋倫的研究對象相隔了一段長時間，或已起了若干變化，才會衍生出這些相異之處。換句話說，他們依然認為蓋倫不可能出錯。
「論人體結構」出版後，便在歐洲各地廣泛傳閱，Vesalius 更因此被任命為羅馬帝國宮廷御醫。年紀只有 28 歲的他被其他醫生同行瞧不起，甚至散佈謠言說他進行活體解剖，而非運用死刑犯的屍體。
