儘管目前正帶領團隊研發對抗武漢肺炎病毒藥物的何大一教授認為，病毒「毫不懷疑源於中國」，駁斥鍾南山「疫情首先出現在中國，但病毒不一定發源於中國」的說法，但中國民眾似乎更相信後者，甚至有人認為病毒源於美國。「華盛頓郵報」報道便指，中國官方正鼓勵散播針對外國的陰謀論。
近日在政府煽動和操縱下，「冠狀病毒起源於美國」一說正在中國互聯網泛濫。支持「美國起源論」的觀點之一，乃指美國政府將武漢肺炎歸類為一般流感，因此掩蓋了愈來愈多病例，甚至在國內或已造成數千人死亡。儘管不同的陰謀論遍及每個國家的互聯網，但報道留意到，自上星期以來，中國網絡上的反美言論，以壓倒之勢猛然激增。
值得注意的是，一般情況下中國網絡審查員會把「出格」的言論刪除，警察亦會迅速拘留散佈謠言者，但近期針對外國疫情的網上言論，未見同樣處理手法。從事中國互聯網研究、加州大學柏克萊分校資訊學院的客座教授蕭強，接受訪問時指：「上微信、微博、百度搜尋，所有話題都是『其他國家都有疫情了』，或者『病毒源自美國』，不同程度的陰謀論在那裡湧現。」
2 月 27 日，中國環球電視網（CGTN）在 YouTube 上傳短片，引述鍾南山說法，對中國病毒起源提出質疑。兩日後，總部位於紐約、由中國人創辦的「留學生日報」（College Daily），便在微信提出「疑問」指：「假如病毒真的源自美國，中國仍應向世界道歉嗎？」同日，微博知名博主「北京人不知道的北京事兒」，轉載一名藥理學家推測，指美國是傳染病起源的短片。分析認為，類似「留學生日報」等網站，已成為中國推動「病毒真正起源於美國」的宣傳機器。
蕭指，就在中共及國家領導人形象受損、被否定之時，出現種種反美言論並非偶然。雜誌「外交政策」（ForeignPolicy）高級編輯 James Palmer 認為，疫情無疑打擊中國形象，故中國官方在關心政治多於疫情的角度出發，掩蓋了早期爆發情況。蕭就形容：「這不單是假資訊或官方說辭這麼簡單，而是中國政府精心策劃，以各種渠道全面發放信息的運動。這種高水平的資訊反擊甚少出現。」
Palmer 亦認同網上「反敘述」（counter-narrative）的幕後推手正是中國政府，並把時間點推得更前。他認為自一開始，中國政府便有意加強反美宣傳，甚至是出於本能的反應。因為過去四年以來，反美主義已佔據中國媒體主導地位。在疫情爆發初期數週，中國官員便一直指責美國反應過度，甚至錯誤斥責美國是首個實施旅遊禁令的國家，試圖將人們原本燒向官方的怒火，轉向外部敵人。
芝加哥大學政治系講席教授楊大利，則不認為現時針對美國的言論氾濫，完全由中國官方推動。楊表示，大量帖文及文章，似乎皆由真實用戶撰寫，只是他們的意見與官方敘述整齊劃一，因此令人懷疑官方是幕後黑手。他補充，這是在「轉移責備」（blame-shifting）心理驅使下，減少對中國如何回應疫情的關注。
無論相關陰謀論是由國家操縱，抑或人民自發，正如 Palmer 所指，中國政府正在默許事情發生。他憂慮若疫情像許多流行病學家所言無法遏制，屆時全球將會尋找罪魁禍首予以譴責，而中國正力求將責任歸咎於美方。
