日本是東亞地區其中一個武肺疫情最嚴重的國家，截至 2 月 28 日，當地累計超過 43 萬宗確診，約 7,800 人死亡。疫情蔓延，東京奧運前景未卜，經濟蕭條，上任才不到半年的菅義偉內閣為此飽受極大政治壓力。然而，日本無論是疫苗接種抑或是自主研發工作，均遠遠落後英美，「外交家」雜誌就有評論文章分析當中原因。
直到 2 月中，全球各地已經有近一億人接種至少一劑疫苗，可是日本到 2 月 17 日才展開疫苗注射計劃，是 G7 國家中最遲的一個。日本政府會優先為約 4 萬名醫護人員接種，當中 2 萬人會接受健康觀察。然後，政府會為 370 萬醫生、護士、藥劑師等其他醫護人員注射疫苗。如一切順利，到 4 月份，計劃就會拓展至所有 65 歲人士，再延伸到各個年齡層。隨著奧運舉行日期逼近，不少國際媒體和專家質疑，為甚麼日本不盡早展開疫苗接種工作。
日本當局強調，安全比速度更重要，現時政府只批准了輝瑞 – BioNTech 疫苗，審批過程也很漫長。輝瑞疫苗的第 3 階段臨床試驗招募了 4 萬多名志願者，當中只有 4% 是亞洲人。由於沒有日本人參與其中，當地有人憂慮安全成效，政府便特意在 10 月中，於本土進行疫苗臨床試驗，以確保疫苗在日本人身上同樣安全和有效，最後共有 200 多名本地人參與其中。政府最終在 12 月才正式批准使用輝瑞疫苗，同時宣佈會為疫苗副作用事故負責任。
除了接種速度慢，日本也很倚賴從外地輸入疫苗。政府已為採購疫苗預留 6,714 億日元（約 490 億港元），現已確保 2.8 億劑輝瑞 – BioNTech、莫德納和阿斯利康疫苗。這四間藥廠現時霸佔了全球市場 70% 到 80% 的疫苗市場。日本醫學水平一直屬於世界一流，歷來共有 5 名諾貝爾醫學藥得主，東京大學醫學院排名也在全球前列。可是早在疫情前，當地疫苗研發行業已落後於其他國家。當每年歐美大型藥廠都會投資數以十億計美元的研究經費時，2016 年厚生勞動省就指日本疫苗行業正面對競爭不足的危機。
「外交家」雜誌形容，當地疫苗業發展疲弱，現時只有大約 10 間日本藥廠正在研發武肺疫苗，只有 AnGes Inc 成功展開更進階的臨床試驗階段，其疫苗會採用質體 DNA 技術（plasmid DNA technology）。另一間知名藥廠塩野義製藥也已經開始初階段的疫苗臨床試驗，該疫苗則是應用了重組蛋白技術（recombinant protein），藥廠希望在 2021 年底，能夠量產足夠 3,000 萬人使用的武肺疫苗。
評論指出，要打入世界疫苗市場，成本十分高昂，除了設備和人工，藥廠也要進行大型、跨國的疫苗接種實驗，研究成功後又要運輸到各個地方，故此要建立龐大的全球商業網絡。很多藥廠和投資者也憂慮疫苗副作用引起的法律風險，日本就曾經出現因子宮頸癌疫苗而引起的訴訟。經過是次教訓後，日本政府表示未來會支持本地疫苗發展，並建立能應對突發公共衛生災難的疫苗研發機制。
評論提到，進口疫苗是現時成本較低的選擇。日本要振興疲弱的疫苗產業，就需要長遠的投資和改革，同時要克服很多結構因素，不過日本或者已別無選擇，投資疫苗產業會是大勢所向，沒有人知道下一次疾病大流行會在何時降臨。
